產品管理機構
USDA負責管理美國產品的立法、認證認可、處罰和國際合作，具體由其農產品市場司（Agricaltural Marketing Service，AMS）下設的NOP負責，內設三個處：標準處、認可和國際合作處、監督處，分別負責機構批準（認可）、投訴處理、案件調查、實施處罰、市場監測、法規、標準、投入物質列表（National List）的修訂、法規標準的解釋等。
USDA下設的國家有機標準理事會（National Organic Standard Board，NOSB）負責對有機標準的制定和修訂提出建議。NOSB由15名成員組成：4名農場主代表、3名環保、3名消費者代表、2名加工者代表、1名零售商代表、1名科學家（生態學、化學、毒理學）代表和1名USDA認可機構的代表。NOSB下設6個分理事會：種植作物分理事會、畜禽分理事會、有機操作分理事會、投入物質管理分理事會、認證認可和合格評定分理事會、政策建議分理事會。

有機標識的使用
有機標識包括兩部分：在產品標簽上標注“有機”字樣和（或）使用美國農業部統一的圓形有機標簽（帶有USDA和Organic字樣）。美國聯邦法規第七章205款D部分規定了有機標識的使用要求。只有通過認證的產品才能使用有機標識（年銷售收入5000美元以下的有機農場除外），并在產品標簽上說明實施有機認證的機構名稱。

美國已與加拿大、歐盟、日本簽署有雙向的互認協議，與中國臺灣簽署了美國出口產品的認可協議，與新西蘭、印度、以色列簽署了進口到美國產品認可協議。
NOP已認可來自澳大利亞、德國、阿根廷、新西蘭、美國、澳大利亞、秘魯、瑞士、意大利、玻利維亞、印度、西班牙、日本、比利時、墨西哥、荷蘭、法國、亞美尼亞、哥斯達黎加、土耳其、巴西、以色列、危地馬拉、加拿大、奧地利、中國臺灣等26個國家和地區的數十家認證機構，這些認證機構可以對所在國（地區）之外的產品進行認證。目前已有來自澳大利亞、德國、日本、美國等10個國家和地區的認證機構在中國開展輸美產品認證。

監管和處罰
認證機構應每年對獲得有機認證的企業和農場進行一次復查，可以采取不預先通知的現場評審。NOP每年對5%以上的獲證產品進行抽樣檢測，并處理認證機構和消費者提出的投訴，投訴處理的結果通常是要求企業按照要求更換標簽、以前未取得認證的企業依法取得認證或采取強制性執行措施。如果采取強制性執行措施，企業將被處以1.1萬美元以下罰款，并暫停或撤銷有機證書。
2010年至今，NOP共查獲23起偽造證書案件。

種子和植物繁殖材料：
?生產者采用有機方式種植的種子、一年生種苗和植物繁殖材料。更多標準可以百度搜索美國產品認證查閱。

認證程序的特別問題
1、認證程序的一般問題，請參考“有機認證步驟簡介”
2、應在現場檢查之前提交并復審有機管理計劃。并且每年應更新，每年要復審。
3、有機管理計劃的任何有關改動例如：新的生產場所或地塊，新作物，新肥料或農藥、新原理供應商，新的加工食品配方，或者新標簽，在使用前要遞交給認證機構批準。
4、特別關注這樣一個事實，經營者拿到被抽到的樣品，要立刻告知他檢驗結果。
5、證書直到被撤銷，暫停或交回都是有效的。如果一個經營者想要停止（暫時或永遠地）NOP認證，應該正式地交回NOP證書。否則，CB暫停它。暫停認證只能由USDA恢復，而不是認證機構。
6、在建議暫停或建議撤銷后，在暫停或撤銷生效前客戶有30天或者與認證機構達成
解決協議（有無第三方的居中調解均可），或者向USDA申訴。
7、為了只使用有效的NOP證書，遵守§ 205.504 (b) (5)。
8、申請者任何時候都可以取回您的證書。您將負責撤銷期間所提供的服務費用(§ 205.402 c)。