筋腐果：又稱條斑病或條腐病，是溫室番茄經常發生危害比較嚴重的一種生理性疾病，其癥狀有兩種類型。
一是褐色筋腐，果實出現局部褐變，甚至出現壞死斑，果面凹凸不平，果肉僵硬，發病初著色不良有明顯綠色或淡綠色斑，切開果肉可見維管束褐變壞死。
二是白型筋腐病，多發生在果實皮部組織上，病部具有蠟樣關澤，質硬，果肉似“糖心狀”，病部著色不良。
筋腐果是因多種不良環境條件綜合作用所致。低溫、高溫、弱光、高夜溫或缺鉀、氮肥過足或病毒感染等因素，都能誘發筋腐果病。其中，缺鉀時發病明顯加重。
防治筋果病采取綜合措施：一是選用不易發病的品種；二是合理密植，適當疏除過密葉，改善光照條件，要特別注意定植時花序定向栽植，使果穗處于操作行一方，能有較好的光照條件：三是施用氮肥，特別要防止一次性追施性氮肥過多，要增施鉀肥和有機肥料，并要嚴防一次性澆水量過大，造成土壤過濕；四是注意噴施300倍靚果安加600倍沃豐素加大蒜油，提高植株的吸收肥力和適應能力，注意防治蚜蟲和病毒病。一旦發生筋腐病果，要立即疏除過密葉片，提高夜晚溫度，噴灑靚果安，并結合灌水沖施有機肥。
空洞果：空洞果是溫室番茄特別是越冬茬番茄，栽培種普遍發生的一種生理性疾病。其癥狀是外觀果實有棱，截斷面呈多角形，切開后可見明顯的空腔。空洞果發生得原因：一是夜間室內溫度過低，果實受精不良，果實內部發育不，形成空腔；二是氮肥用量過多；三是缺少二氧化碳或光照條件，光合產物不足；四是用激素藥液蘸花時，配制濃度過大，或蘸花時花蕾幼小，發育不夠健全，部分形成空洞果。