自動化立體倉庫的上游、下游及其內部各子系統的協調，有一個木桶效應的問題，即短的那一塊木板決定了木桶的容量。有的倉庫采用了很多的高科技產品，各種設施設備也非常，但是由于各子系統間協調性、兼容性不好，造成整體運作能力比預期差很多。
作為物流中心的重要組成部分，自動化立體倉庫（Automatic Storage & Retrieval System）直接影響到企業制定的戰略和計劃、指揮和調整企業的行動。這里，簡單談一下它的設計步驟，一般分為以下幾步：
一、收集、研究用戶的原始資料，明確用戶所要達到的目標，這些原始資料包括：
1、明確自動化立體倉庫與上游、下游銜接的工藝過程，
2、物流要求：上游進入倉庫的大入庫量、向下游轉運的大出庫量以及所要求的庫容量；
3、物料的規格參數：物料的品種數、物料包裝形式、外包裝尺寸、重量、保存方式及其它物料的其它特性；
4、立體倉庫的現場條件及環境要求；
5、用戶對倉庫管理系統的功能要求；
6、其它相關的資料及特殊要求。
輸送系統
根據物流圖，合理選擇輸送機的類型，包括：輥道輸送機、鏈條輸送機、皮帶輸送機、升降移載機、提升機等。同時，還要根據倉庫的瞬時流量合理確定輸送系統的速度。
其它設備
根據倉庫的工藝流程及用戶的一些特殊要求，可適當增加一些輔助設備，包括：手持終端、叉車、平衡吊等。
五、初步設計控制系統及倉庫管理系統（WMS）的各功能模塊
根據倉庫的工藝流程及用戶的要求，合理設計控制系統及倉庫管理系統（WMS）。控制系統及倉庫管理系統一般采用模塊化設計，便于升級和維護。
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