醫療污水處理工藝選擇的原則：
a、傳染病醫院采用二級處理，并需進行預消毒處理。
b、處理出水排入自然水體的縣及縣以上醫院采用二級處理。
c、處理出水排入城市下水道的綜合醫院推薦采用二級處理，對采用處理工藝的加強處理效果。
d、對于經濟不發達地區的小型綜合醫院，條件不具備時可采用簡易生化處理作為過渡處理措施，之后逐步實現二級處理或加強處理效果的處理。
焚燒法
①將可燃性物質的廢液，置于燃燒爐中燃燒。如果數量很少，可把它裝入鐵制或瓷制容器，選擇室外安全的地方把它燃燒。點火時，取一長棒，在其一端扎上沾有油類的破布，或用木片等東西，站在上風方向進行點火燃燒。并且，監視至燒完為止。
②對難于燃燒的物質，可把它與可燃性物質混合燃燒，或者把它噴入配備有助燃器的焚燒爐中燃燒。對多氯聯苯之類難于燃燒的物質，往往會排出一部份還未焚燒的物質，要加以注意。對含水的高濃度有機類廢液，此法亦能進行焚燒。
③對由于燃燒而產生NO2 SO2 或HCl 之類有害氣體的廢液，用配備有洗滌器的焚燒爐燃燒。此時，用堿液洗滌燃燒廢氣，除去其中的有害氣體。
④對固體物質亦可將其溶解于可燃性溶劑中然后使之燃燒。
水解法
對有機酸或無機酸的酯類，以及一部份有機磷化合物等容易發生水解的物質，可加入氫氧化鈉或氫氧化鈣， 在室溫或加熱下進行水解。水解后，若廢液害時，把它中和、稀釋后，即可排放。如果含有有害物質時，用吸附等適當的方法加以處理。
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