通常情況下，醫院污水需要集中收集，經醫院內部的醫療污水處理系統處理消毒后，流入城市污水管網，再經污水處理廠處理后可作為終水排放。其中，醫療污水處理的過程包括網格處理(剝離顆粒較大的雜物，如石塊、塑料袋等。)、生化處理(好氧部分)和厭氧處理(厭氧部分，好氧和厭氧過程均可達到有效殺菌)，之后進行24小時沉淀處理，加藥消毒(此階段一般使用活性氧消毒粉)，從而監測COD、BOD等相關指標的達標情況。另外，在集中處理之前，醫療污水是通過的管道收集的，這個過程一般是封閉的。

實驗室污水處理流程大致分為三個主要步驟，包括預處理，主要處理和二次處理。
　　1、是預處理，它旨在去除進入處理過程的大顆粒物和沉淀物。這些物質通常來自于實驗室中的懸浮固體物質，比如細胞，細菌等。預處理可以采用鏡像過濾，離心等方式。

　　2、是主要處理，主要處理的目標是去除水中的有機物質、氮和磷鹽等污染物。這一步驟的實現通常采用生物處理方式，也就是通過微生物將污染物質分解掉，通常會使用生物濾池或污泥法系統來處理。

　　3、是二次處理，其目的是去除在主要處理中沒有被去除的殘余污染物，這需要進一步處理。例如，用深度過濾技術將污染物在化學過濾和膜過濾中去除。

調試步驟：
　　1、清水注滿接觸生化池。

　　2、啟動風機，對池內污水進行曝氣充氧。

　　3、重新進水，繼續曝氣。

　　4、如此反復運行，每天進水時間相對延長。

　　5、同時也可觀察接觸生物池內填料情況。

　　6、微生物的馴化需要較長時間，這樣可加快生物膜的形成。

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