作為甜味劑：異麥芽酮糖因其甜度適中、口感，被廣泛應用于糖果、飲料、糕點等食品中，可以單使用或與蔗糖混合使用。
遮蔽異味：異麥芽酮糖對DHA的魚油味、蔬果汁的異味和豆奶的豆腥味等有很好的掩蓋效果。
穩定劑：在酸性食品中，異麥芽酮糖比蔗糖更穩定，能保持產品的甜味和滲透壓。
在農業領域，異麥芽酮糖可能不是直接應用的物質。然而，其作為一種天然存在的糖類，可能在某些農業生物技術或植物生理研究中作為研究材料或培養基成分使用。
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