中藥超微粉碎后其物理性能、化學性能、毒副作用可能發生改變，其臨床配方、劑量也可能發生變化，其制劑成型、體內吸收、片劑硬度、崩解等，這些都有待于進一步研究。對微粉化技術在中醫臨床的應用，有賴于中藥基礎和臨床研究工作的加強。中藥超微粉碎技術在發揮單一藥材藥效方面有很大的優勢，但對于制劑特別是傳統中醫方劑中需要煎煮使用的中藥，它是否適合還值得探討。許多研究證實，很多中藥煎劑中單一成分有些無藥理作用或藥理作用很小，但當與其他藥材共煎后就會產生很強的藥效，說明在煎煮過程中發生了化學變化。
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