在成本方面，雖然甲醇制氫分布式能源系統的初始投資相對較高，包括甲醇制氫設備、燃料電池、儲能裝置等的購置和安裝費用，但從長期運行成本來看，具有一定的競爭力。
在偏遠海島的分布式能源系統中，由于交通不便，傳統能源運輸困難，甲醇制氫技術憑借其原料易于儲存和運輸的優勢，為海島提供了可靠的能源供應。同時，該系統采用的甲醇制氫燃料電池發電方式，減少了污染物排放，保護了海島的生態環境 。
甲醇制氫現場應用的經濟效益評估涵蓋投資成本、運營成本和收益等多個關鍵方面，這些因素相互關聯，共同影響著甲醇制氫項目的經濟可行性和盈利能力。投資成本主要包括設備購置和安裝費用。以一個日產 1000 公斤氫氣的甲醇制氫加氫一體站為例，設備投資通常在 500 - 1000 萬元左右 。
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